检察机关办理刑事案件时，在审查起诉阶段发现犯罪已过追诉时效的，应当作出( )的决定。A．免予起诉B．不起诉C．撤销案件D．宣告无罪

根据《刑事诉讼法》第223条规定，选项A不正确，选项B正确。另根据《刑事诉讼法解释》第310条和第311条规定，选项C不正确。根据《刑事诉讼法》第226条规定，选项D正确。综上，本题应选AC。


根据《刑事诉讼法》第15条和《人民检察院刑事诉讼规则（试行）》第401条第1款规定，选项A、C是正确的。选项B中犯罪嫌疑人乙的行为属于犯罪预备，根据《刑法》第22条的规定，对于预备犯，可以比照既遂犯从轻、减轻处罚或者免除处罚。因此检察院可以作出而不是应当作出不起诉的决定。故选项B不正确。因此本题答案为AC。


根据《公务员法》第90条规定，A所指的申诉期限的起算点错误，应选。根据第91条第2款规定，复核、申诉期间不停止人事处理决定的执行。B错误，应选。公务员在受处分期间不得晋升职务和级别，其中受记过、记大过、降级、撤职处分的，不得晋升工资档次，并未指明不能享受年终奖金，所以C错误，应选。解除处分后，晋升工资档次、级别和职务不再受原处分的影响。但是，解除降级、撤职处分的，不视为恢复原级别、原职务。D项错误，应选。


对乡政府的决定不服应该向乡政府或县政府提出，而非向其上上级——市政府提出。A项错误，不选。根据《信访条例》第21条和第22条第2款规定，B错误，不选。县级以上人民政府才应当设立信访工作机构，其他是根据需要设立信访工作机构或者人员，因此工商局并不一定非得设立信访工作机构不可，C错误。


国家赔偿的范围只包括直接损失，不包括间接损失和可得利益的损失。对于县工商局的违法扣押行为，某厂只能要求返还扣押的财产。不能履行合同的损失属于可得利润的损失，B应选；名誉损失属于精神损害的范围。至于停产损失，只在被吊销许可证和执照、责令停产停业时适用，而且只赔偿停产停业期间必要的经常性费用开支，某厂并未被吊销许可证和执照或责令停产停业，也并不确定停产的100万元是否属于经常性、必要的费用开支，因此D应选。