不能引起垂直传播的病毒是：A、乙型肝炎病毒B、风疹病毒C、巨细胞病毒D、艾滋病病毒E、乙型脑炎病毒

垂直传播：指通过胎盘或产道，病毒直接由亲代传播给子代的方式。常见导致垂直传播的病毒有风疹病毒、乙型肝炎病毒（HBV）、AIDS病毒（HIV）、丙型肝炎病毒（HCV）、巨细胞病毒（CMV）等十余种，可引起死胎、流产、早产或先天性感染或先天性畸形等。
脊髓灰质炎病毒是引起脊髓灰质炎的病毒。该疾病传播广泛，是一种急性传染病。病毒常侵犯中枢神经系统，损害脊髓前角运动神经细胞，导致肢体松弛性麻痹，多见于儿童，故又名小儿麻痹症

垂直传播指病原体从宿主的亲代向子代的传播方式，已知有十多种病毒可引起垂直感染，其中以艾滋病病毒(HIV)、乙型肝炎病毒(HBV)和风疹病毒为多见。梅毒螺旋体可从母体通过胎盘传染给胎儿，引起先天性梅毒。所以不能通过垂直传播的病原体为流行性乙型脑炎病毒。D选项正符合题意，其他选项均不符合题意，故本题选D。

掌握乙型脑炎病毒等主要病毒病的传播途径。垂直传播有别于水平传播，为经母体的胎盘或围生期经产道等，将病原体传染给胎儿或新生儿，称为先天性感染。能通过垂直传播的病原体有艾滋病、乙型肝炎、风疹等病毒，以及梅毒螺旋体等。流行性乙型脑炎病毒属于黄病毒属病毒，只能经蚊子叮咬虫媒传播，属于水平传播的病毒。

脊髓灰质炎病毒是引起脊髓灰质炎的病毒。该疾病传播广泛，是一种急性传染病。病毒常侵犯中枢神经系统，损害脊髓前角运动神经细胞，导致肢体松弛性麻痹，多见于儿童，故又名小儿麻痹症。