多个单位联合研制的新药允许A．多个单位重复申请注册B．其中一个单位申请注册，其他单位不得重复申请C．治疗尚无有效治疗手段的疾病的新药在联合申请注册批准后，每个品种可由多个单位生产D．需要联合申请注册的，应当共同署名作为该新药的申请人E．治疗尚无有效治疗手段的疾病的新药在联合申请注册批准后，每个品种只能由一个单位生产，同一种的不同规格可分由不同单位生产

《商标法》第二十二条规定，商标注册申请人应当按规定的商品分类表填报使用商标的商品类别和商品名称，提出注册申请。商标注册申请人可以通过一份申请就多个类别的商品申请注册同一商标。因此，选项A正确。《商标法》第二十二条规定，商标注册申请等文件，可以以书面方式或者数据电文方式提出。因此，选项C正确。注册商标需要改变其标志的，应当重新提出注册申请E选项错误。综上，本题正确答案为AC。

本题考查的是一级建造师的注册。选项C属于变更注册的情况，不属于不予注册的情形。参见教材P74。

注册咨询工程师（投资）需要变更执业单位或专业，应申请变更注册。申请变更执业单位的材料包括：《中华人民共和国注册咨询工程师（投资）变更注册申请表（单位变更）》；《中华人民共和国注册咨询工程师（投资）注册证》及复印件；新执业单位出具的正在生效的1年以上任用（聘用）证明；申请人与原执业单位的解聘证明。申请变更执业单位的材料包括：《中华人民共和国注册咨询工程师（投资）变更注册申请表（专业变更）》；执业单位出具的与新申请专业相关的工程咨询业绩证明材料；学制在1年以上的与新申请专业相关的专业培训、学历或学位证明。